Η γαστρεντερική μορφή του Isospora περιγράφεται καλά στα Passeriformes, αλλά υπάρχουν λίγες αναφορές για τη σπλαχνική μορφή του. Επομένως, για την αξιολόγηση της σπλαχνικής μορφής του στα καναρίνια με σύνδρομο «μαύρης κηλίδας», παρασκευάστηκε γαστρεντερικό περιεχόμενο από 50 καναρίνια που χάθηκαν και εμφανίστηκαν με μαύρη κηλίδα κάτω από το δέρμα της κοιλιάς. Ταυτόχρονα, συλλέχθηκαν δείγματα ιστών από σπλαχνικούς ιστούς. Μετά την προετοιμασία των δειγμάτων, οι ωοκύστεις μετρήθηκαν στο πεπτικό περιεχόμενο. Συνολικά 7 από τα 50 καναρίνια εμφάνισαν ωοκύστεις στα κόπρανα τους. Μετά την ταυτοποίηση των μολυσμένων πτηνών, παρασκευάστηκαν ιστοπαθολογικές τομές από τους σπλαχνικούς ιστούς τους. Οι σπλαχνικοί ιστοί περιελάμβαναν την καρδιά, το ήπαρ και το έντερο. Φλεγμονή και υπεραιμία παρατηρήθηκαν στη μικροσκοπική όψη της καρδιάς, αλλά δεν παρατηρήθηκε στάδιο ανάπτυξης παρασίτων. Το ήπαρ παρουσίασε φλεγμονή καθώς και το ασεξουαλικό αναπαραγωγικό στάδιο του παρασίτου. Το ασεξουαλικό αναπαραγωγικό στάδιο του παρασίτου παρατηρήθηκε και στο έντερο.
